לשכת ראש הממשלה הגיבה לתצהיר של ראש השב"כ רונן בר לבג"ץ והאשימה אותו ב"תצהיר רצוף שקרים" שחושף, לטענתם, את כשליו. נתניהו האשים את בר בשלל האשמות, בהן: "רונן בר מצהיר שבליל השבעה באוקטובר הוא העיר את המערכת כולה. הוא רק שוכח לציין שהוא לא העיר את ראשי המערכת, ראש הממשלה ושר הביטחון. לו היה עושה זאת, הטבח היה נמנע".

טענה נוספת של נתניהו היא כי ראש לשכתו של בר התקשר למזכיר הצבאי של נתניהו רק ב-06:13 ולא קודם לכן כפי שטוען בר. עוד מוסיף נתניהו כי "בכך בר מאמת את קביעת כל שרי הממשלה שהוא נכשל כישלון מחפיר בשבעה באוקטובר. סיבה זו לבדה מחייבת את סיום תפקידו". עם זאת, הדיון בבג"ץ דן בשאלה אם הסיבה להדחת בר היא חקירות השב"כ את סביבת נתניהו.